Marcus Agius sinh ngày 22 tháng 7 năm 1946, là con trai của Ena Eleanora và Trung tá Alfred Victor Louis Benedict Agius. Ông là người gốc Maltese và được đào tạo tại trường Cao đẳng St George, Weybridge. Ông có bằng cấp ngành khoa học cơ khí và các ngành kinh tế tại Trinity Hall, Cambridge, và bằng MBA từ trường Đại học kinh doanh Havard.

Năm 2010, The Tablet đưa tên ông là một trong những người Công giáo La Mã có ảnh hưởng nhất nước Anh.[2]